Тема форума: «Возникновение жизни»

Лука, свои мысли по поводу обновлённого варанта твоей статьи "Что было первым - метаболизм или ген?" изложил в своём комментарии к оной статье.

По поводу гипотезы происхождения эукариот от клостридий в результате "сбоя" процесса спорогинеза. Идея, как мне кажется, очень любопытная и плодотворная. Но я бы её слегка модифицировал. Ни к чему привлекать на мой взгляд малореалистичный процесс "подмены" клеткой древней археи дочерной клетки в процессе спорогинеза. Исходя из бритвы Оккама логичнее предположить, что и бактерии с двойной мембраной и эукариоты произошли в результате каких-то мутационных процессов в спорогенерирующих бактериях, приведших в первом случае к перерождению мембраны их материнской клетки во внешнюю мембрану грам-отрицательнных бактерий, а во втором случае к перерождению дочерной клетки спорогинезной бактериий в ядро эукариотической клетки. При этом, в случае эукариотов, они произошли скорее всего не от клостридий, а от их близких родственников - актиномицетов - http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D0%BA%D1%82%D0%B8%D0%BD%D0%BE%D0%BC%D0%B8%D1%86%D0%B5%D1%82%D1%8B , многие из которых тоже способны формировать споры. При таком сценарии эукариоты являются вместе с археями сестринскими группами, произошедшими от актиномицетов или, как вариант, от ныне вымершей группы бактерий, которые имели общие черты клостридий, бацилл, и актиномицетов. Судя по всему, эта группа сформировалась в результате симбиоза грам-положительной бактерии и бактериофага (иногда вирусам оказывается выгоднее не убивать клетку сразу, а встроиться в её геном, что бы он тиражировался самой клеткой в процессе её деления). Подробнее эта гипотеза изложена здесь - http://www.biology-direct.com/content/6/1/16

То, что предок эукариот обладал многоими чертами, свойственными актиномицетам можно подкрепить следующими соображениями:
1. Именно у актиномицет есть практически полный набор генов для синтеза прекурсора стерола, считающегося одной из основных "визитных карточек" эукариот.
2. Эукариты - аэробы, а археи и клостридии облигатные или факультативные анаэробы. В то же время, актиномицеты как раз, в основном, аэробы.
3. Актинобактерии, включая актиномицентов, активно "сосут" водород из атмосферы (по некоторым оценкам, они обеспечивают до 80% от общих источников поглащения атмосферного водорода).
4. По некоторым признакам (прежде всего, формированию мицелия) прослеживаются явные аналогии актинобактений с низшими грибами.
5. Те немногочисленные случаи, когда бактерии обладают не кольцевым, а линейным геномом, обнаруживаются преимущественно как раз у актиномицетов.

По видимому, именно химерный состав генома первых эукариот, изначально получивших от сроднившегося с ними вируса серьёзный аппаратный багаж, облегчающий манипулирование генетическим материалом, и позволил им успешно вступать в симбиотические отношения со многими бактериями, постепенно перетаскивая в свой ядерный геном наиболее ценные гены своих "постояльцев".

LUСA, я отправил на указанный тобой адрес результаты своей возни с геномами клостридий. Не знаю, когда руки дойдут продолжить это занятие, но, может быть, что-то из того, что мне уже удалось нацедить в сентябре, покажется тебе интересным. Если будут вопросы или комментарии - пиши сюда или прямо на мыло.