автор: Combinator сообщение 9624 Ещё мне понравился комментарий второго рецензента по поводу того, что этот метаболизм в настоящее время сохранился лишь у клостридий. Типа, это ничего не доказывает, но вот если бы клостридии были самой древней группой бактерий, ведущей свою родословнюю непосредственно от LUCA, тогда было бы другое дело. |
Дописываю статью "РНК-пептидный мир до возникновения кодируемого пептидного синтеза".
Опять всплывают клостридии и кодазы.
Есть немало разных и независимых аргументов в пользу того, что
АРСазы второго класса (кому этот термин кажется загадочным - см. мою статью "Кодазы помогают понять..." ) более древние по сравнению с
АРСазами первого класса. Кстати эти
АРСазы породили огромное количество генных семейств - от аминокислотных синтетаз (например, гистидина или аспарагина) до РНК и ДНК-полимераз и транспептидаз. Одно из них - транспептидазы, которые нерибосомно синтезируют пептиды. Возможно это и есть ключ к возникновению первых белков до рибосомы.
Особенно интересны гомологи одной атипичной сериновой
АРСазы, дающие нерибосомные пептидазы. Эти гомологи атипичной архейной сериновой
АРСазы были найдены в
геномах различных бактериальных видов, преимущественно принадлежащих группам α- и β-протеобактерий, а также некоторых представителей родов Clostridium, Bacillus и Streptomyces.
Чем больше знакомлюсь с этими пептидазами, тем больше уверенности, что на раннем дорибосомном этапе D-аминокислоты также были в употреблении, но впоследствии они остались важны лишь как субстрат для транспептидаз пептидогликана (псевдопептидогликана архей) и тейхоевых кислот, а также пептидов-регуляторов.
Так что если спросить, какой белок будет главным кандидатом на "прародителя", я бы предположил - предковый вариант
АРСаз второго класса, существовавший ещё в дорибосомный период. Это не значит, что в период формирования рибосомного синтеза белков уже не было
АРСаз первого класса и многочисленных его функциональных гомологов - от синтаз веществ, участвующих в регуляции окислительного стресса (всяких тиолов) до пептидаз.
Ну а в статье "Кодазы..." аргументируется их попарное расположение на древних
тРНК.
29.03.2012г. 9:19:47