Ознакомьтесь с Условиями пребывания на сайте Форнит Игнорирование означет безусловное согласие. СОГЛАСЕН
ВХОД
 
 
Короткий адрес страницы: fornit.ru/1841 
Содержание журнала Достижения науки, техники и культуры
Ссылка на первоисточник статьи: http://www.popmech.ru/article/11672-genyi-i-prochiy-musor/.

ГЕНЫ И ПРОЧИЙ МУСОР: ПРОЕКТ ENCODE

 

От ДНК до хромосомы
Геном человека, как совокупность всей наследственной информации, содержит далеко не одни только гены, то есть кодирующие белки фрагменты ДНК. Намного большую его часть составляют некодирующие последовательности. Когда в 1990-х шла работа над международным проектом «Геном человека», основное внимание по понятным причинам было уделено именно кодирующим генам. Каково же было удивление ученых, когда выяснилось, что они составляют максимум 3% нашего генома! Миллиарды оснований ДНК, казалось бы, вообще бессмысленны – недаром они получили едва ли не презрительное название «мусорной ДНК».
Насчет ее биологической роли имеются разные предположения. Такая ДНК может кодировать не белки, а разные виды «малых» РНК – транспортной, рибосомальной, ядрышковой и т.д., может играть роль в регуляции активности генов и «созревании» матричной РНК, в упаковке ДНК в хромосомы и даже в снижении опасности мутаций: любые «ошибки», возникающие по той или иной причине в ДНК, скорее всего, «попадут» именно на эту, ничего не значащую и никому не нужную часть.
Чтобы разобраться с этой проблемой генетики начали реализацию масштабного проекта – «Энциклопедия элементов ДНК» (Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE), который уже сегодня принес ряд интересных находок, показав, что масса фрагментов той самой «мусорной» ДНК играют весьма важную роль в жизни человека. Как и следовало ожидать, часто они выполняют регуляторную функцию – к примеру, активируя или деактивируя соответствующие гены в ходе созревания и дифференциации клеток, превращении их, скажем, в нефроны почек или нейроны мозга. «В геноме есть масса всего помимо генов», - говорит один из участников проекта ENCODE Марк Герштейн (Mark Gerstein).
В рамках работы по проекту исследователи из более чем 30-ти институтов разных стран мира проводят компьютерный анализ ДНК-последовательностей, биохимические эксперименты и секвенирование, работая с человеческими клетками 147-ми различных типов. Конечная цель выглядит весьма масштабной: установить конкретную задачу, которой служит каждое из более чем 3 млрд оснований, составляющих наш геном.
По полученным данным, ту или иную активность демонстрирует около 80% этих оснований. Одни служат сайтами для связывания белков, регулирующих активность генов. Другие становятся основой для синтеза тех или иных видов РНК, помимо матричной (мРНК), на которой затем синтезируется белок. Третьи позволяют эффективно упаковать ДНК в хромосому... Словом, многие высказанные ранее гипотезы находят свое подтверждение. И все равно ENCODE существенно меняет современные представления о работе генома.
К примеру, выяснилось, что в ту или иную форму РНК превращается 76% нашей ДНК – намного больше, чем считалось исходя из теоретических оценок. В это число входит чуть менее 21 тыс. мРНК, кодирующих белки – удивительно мало! Кроме того, в ДНК содержатся последовательности, кодирующие 8,8 тыс. малых РНК разных типов и 9,6 тыс. длинных некодирующих молекул РНК длиной более 200 оснований. Было также идентифицировано 11224 фрагмента «псевдогенов» (генов, не проявляющих активность вообще, либо в конкретном типе клетки, либо у конкретного индивидуума).
В ходе проекта было выявлено порядка 4 млн сайтов, выполняющих роль регуляторов генной активности. Они могут располагаться как в непосредственной близости от регулируемого гена, так и на порядочном удалении от него, могут действовать поодиночке или в различных комбинациях, по-разному в различных клетках и у разных людей. Регуляция в геноме оказывается едва ли не более важной и сложной, чем сами гены.
В настоящее время в рамках проекта ENCODE создается полноценная карта человеческого генома, в котором каждому участку и каждому основанию будет приписана соответствующая роль. «Это как Google Maps для генома, - говорит Элиза Фейнгольд (Elise Feingold), одна из координаторов и руководителей программы, - В Google Maps можно найти нужное место и рассмотреть его во всех нужных видах и аспектах. Так же и в ENCODE можно ”приблизить” нужный участок ДНК – от масштаба хромосомы до отдельных оснований – и рассмотреть его функциональность во всех деталях».
По публикации ScienceNOW


Обсуждение Еще не было обсуждений.




Оценить статью >> пока еще нет оценок, ваша может стать первой :)

   
Архив новостей
Анонсы новостей    http://www.scorcher.ru/xml/news.rss - что это?
Трилогия Основы фундаментальной теории сознания
Трилогия: Основы фундаментальной теории сознания.
11-08-2024г.

Практическая теория сознания опубликована в научном журнале
Практическая теория сознания опубликована в научном журнале: Принципы фундаментальной теории сознания на основе модели МВАП.
15-07-2024г.

Книга Субъективность
Книга о сознании, о сути субъективного опыта (квалиа): Субъективность.
07-06-2024г.

Путь решения проблемы сознания
Схемотехника адаптивных систем - Путь решения проблемы сознания.
07-02-2024г.

Развитие квалиа в онтогенезе или как именно мы все ощущаем
Последовательность формирования субъективных абстракций в механизмах произвольности выбора: Развитие квалиа в онтогенезе или как именно мы все ощущаем.
20-12-2023г.

Факторы деструктивного влияния в обществе: политика, реклама, соцсети, биржи, религия
Политические элиты все в большей степени паразитируют на обществе: Факторы деструктивного влияния в обществе: политика, реклама, соцсети, биржи, религия.
13-11-2023г.

Система децентрализованного управления обществом
Какой может быть эффективная система децентрализованного управления обществом: Система децентрализованного управления обществом.
08-09-2023г.

Принципиальные элементы фундаментальной теории сознания
Для верификации: Принципиальные элементы фундаментальной теории сознания.
07-08-2023г.

Коротко и ясно про мозг человека
Организации механизмов мозга человека: Коротко и ясно про мозг человека.
08-07-2023г.

Проблемы восприятия программной реализации искусственного разума
Анонсирование Beast: Проблемы восприятия программной реализации искусственного разума.
06-02-2023г.

 посетителейзаходов
сегодня:00
вчера:00
Всего:32533457